Estonya'da zorunlu KDV kaydı için ciro eşiği, bir takvim yılının başından itibaren 40.000 Euro'dur. Yıllık vergiye tabi arzınız 40.000 Euro'nun altındaysa KDV'den sorumlu kişi olarak kaydolma yükümlülüğünüz yoktur ve Estonya'da sağlanan hizmetler üzerinden aksi takdirde vergilendirilebilecek olan KDV'yi hesaplamanız ve ödemeniz gerekmez.

Kayıt eşiğine ulaşmadan önce gönüllü kayıt da mümkündür. Bu durumda, Estonya Vergi ve Gümrük Kuruluna bir iş kurma ve yürütme niyetini kanıtlayan yeterli kanıtın (normalde bir iş planı) sağlanması gerekir. Estonya'da bulunan ve faaliyet gösteren müşterilerle herhangi bir işlem yoksa, Estonya vergi makamları KDV kaydını reddedebilir.

KDV ile ilgili detaylı bilgiler Estonya Vergi ve Gümrük Kurulu'nun e-Residency sayfasından okunabilir.